大棚櫻桃生長環境相對封閉，通風透光條件差，容易感染花腐病、灰霉病、褐斑穿孔病等病害；另外，介殼蟲、食現蟲、葉螨等蟲害也經常發生，特別是食心類害蟲，如不提前預防，等到發現時已鉆入花器內部蛀食子房，而此時正值花期，棚內放蜂授粉，無法進行藥劑防治，因此會造成很大損失。

防治大棚櫻桃病蟲害首先要加強溫、濕度調控，防止空氣濕度過高，經常通風換氣，改善生存環境，防止病菌滋生。

其次，在大櫻桃生長的不同物候期，殺菌劑與殺蟲劑科學混配防治，具體做法是：萌芽期徹底清園，打好基礎，在芽露紅頭時用戊唑醇+代森錳鋅+噠螨靈+殺撲磷礦物油按藥品說明推薦劑量兌水混配，全園噴霧，務必均勻細致，不留死角。芽露青時，用復配型殺菌劑（如愛苗或百泰或世高）+殺卵能力強的殺蟲劑（如滅多威），預防褐斑穿孔病和食心蟲，還可添加補硼的葉面肥，壯蕾孕花。

棚內有少量開花時，噴一遍腐酶劑，預防灰霉病，添加殼聚糖或海藻酸等優質葉面肥，提高座果率。謝花后，噴腐霉利+百泰+勁彪（高效氯氟氰菊酯），添加殼聚糖或海藻酸等優質葉面肥，提高座果率。幼果期，再噴泰+殼聚糖或海藻酸優質葉面肥，減輕生理落果。采果后，補噴一次保護性殺菌劑，如甲托或大生防止落葉，添加高磷的葉面肥，促進花芽分化。每次噴藥時，都要選擇在晴天的上午10時以前或下午3—5時，以防發生藥害。